Система идентификации микроорганизмов IDPlus (AXIMA@SARAMIS) (Shimadzu, Япония)

Система на базе MALDI масс-спектрометров семейства AXIMA и MALDI-7090, совмещенная с программным обеспечением SARAMIS, обеспечивает высокую воспроизводимость анализа, заменяет стандартные биохимические методы и позволяет получить достоверный результат всего за две минуты.

SARAMIS™ – (Spectral ARchive And Microbial Identification System) - экспертная система на основе базы масспектрограмм интактных микроорганизмов производства SHIMADZU GROUP. Предназначена для типирования микроорганизмов на основании их масс-спектров.

Информация в базе данных (БД) SARAMIS организована в виде так называемых СуперСпектров (Superspectra™). Под этим термином подразумевается, что для каждого вида микроорганизмов сформирован характерный набор белков (биомаркеров), полученный на основе анализа не менее 20 масс-спектров этого вида. При этом образцы получены из различных источников (больниц, лабораторий, микробиологических коллекций). Каждый образец тщательно идентифицирован с помощью последовательности 16s РНК или других сертифицированных методов анализа. Для родов и семейств охарактеризованных микроорганизмов сформированы наборы присущих только им биомаркеров. Структурированная таким образом база данных позволяет быстро и точно идентифицировать микробиологические штаммы, а при невозможности – примерно определять место микроорганизма в таксономической иерархии. По состоянию на начало 2009 года накоплены суперспектры более чем для 1600 видов и 230 родов. В БД SARAMIS™ входит также коллекция первичных масс-спектров микроорганизмов (FingerprintSpectra), состоящая из более чем 50.000 образцов.

 Всего два шага до результата:

Шаг 1: Подготовка образца

На подложке смешивают биоматериал из колонии бактерий и специальную матрицу (2',5' дигидроксибензойная кислота).

Шаг 2: Идентификация

После этого образец помещают в прибор и подвергают воздействию наносекундных лазерных импульсов. При этом молекулы матрицы и аналита (в частности, белки) переходят в газовую фазу, а протонированные молекулы матрицы взаимодействуют с белками, перенося на них положительный заряд. Под действием электрического поля ионизированные белки движутся от источника ионизации к детектору с ускорениями, обратно пропорциональными их атомным массам. Программное обеспечение прибора оценивает время пролета частиц и преобразует эту информацию в спектр молекулярных масс (масс-спектр).
Масс-спектр сравнивается со спектрами из базы данных AXIMA@SARAMIS, и на основании сведений о массах характеристических белков происходит идентификация микроорганизмов.

Диагностика инфекционных заболеваний человека и животных, фундаментальные научные исследования, разработка новых лекарств: анализ и сравнение белковых профилей бактериальных штаммов, устойчивых к лекарствам, для поиска новых мишеней фармакологического воздействия; стандартизация микробиологических коллекций: быстрое сравнение и классификация штаммов из различных изолятов; пищевая промышленность: анализ присутствия нежелательных микроорганизмов на ранних стадиях производства.